In Museum Waterland is uiteenlopende hedendaagse kunst te zien. Van schilderijen en animaties tot meubels en voorwerpen. Er zijn wisselende collecties.
In Museum Waterland wordt veel georganiseerd. Jaarlijks zijn er concerten, lezingen, rondleidingen en cursussen. Ook is er een speciale leeszaal met kunsttijdschriften.